Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

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Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
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PTPRUQ92729 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PTPRUQ92729 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC30■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
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