Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
TRIM41Q8WV44 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TRIM41Q8WV44 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TRIM41Q8WV44 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms