Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA4

GTF3C2, General transcription factor 3C polypeptide 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2Q8WUA4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C2Q8WUA4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C2Q8WUA4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C2Q8WUA4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C2Q8WUA4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C2Q8WUA4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C2Q8WUA4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C2Q8WUA4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C2Q8WUA4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C2Q8WUA4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C2Q8WUA4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C2Q8WUA4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C2Q8WUA4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C2Q8WUA4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C2Q8WUA4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C2Q8WUA4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C2Q8WUA4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C2Q8WUA4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C2Q8WUA4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C2Q8WUA4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C2Q8WUA4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C2Q8WUA4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C2Q8WUA4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C2Q8WUA4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C2Q8WUA4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C2Q8WUA4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C2Q8WUA4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C2Q8WUA4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C2Q8WUA4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C2Q8WUA4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C2Q8WUA4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C2Q8WUA4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C2Q8WUA4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C2Q8WUA4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C2Q8WUA4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C2Q8WUA4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C2Q8WUA4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C2Q8WUA4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C2Q8WUA4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF3C2Q8WUA4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF3C2Q8WUA4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C2Q8WUA4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms