Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM58Q8NG06 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM58Q8NG06 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms