Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARMIL3Q8ND23 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CARMIL3Q8ND23 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms