Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM87AQ8NBN3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM87AQ8NBN3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms