Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC63Q8NA47 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC63Q8NA47 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms