Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC89Q8N998 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms