Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC155Q8N6L0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC155Q8N6L0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms