Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MSL3Q8N5Y2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms