Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U4

STAG2, Cohesin subunit SA-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG2Q8N3U4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
STAG2Q8N3U4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STAG2Q8N3U4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms