Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMYD4Q8IYR2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms