Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERC6Q8IVU3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms