Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUX4

APOBEC3F, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3FQ8IUX4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC3FQ8IUX4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOBEC3FQ8IUX4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms