Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS37DQ86XT2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS37DQ86XT2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS37DQ86XT2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS37DQ86XT2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS37DQ86XT2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS37DQ86XT2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS37DQ86XT2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS37DQ86XT2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS37DQ86XT2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS37DQ86XT2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS37DQ86XT2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS37DQ86XT2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS37DQ86XT2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS37DQ86XT2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS37DQ86XT2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS37DQ86XT2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS37DQ86XT2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS37DQ86XT2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
VPS37DQ86XT2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS37DQ86XT2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS37DQ86XT2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS37DQ86XT2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS37DQ86XT2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms