Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNMB4Q86W47 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNMB4Q86W47 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms