Protein–RNA interactions for Protein: Q86U02

LINC00596, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00596, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00596Q86U02 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00596Q86U02 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00596Q86U02 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00596Q86U02 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00596Q86U02 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms