Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HS2ST1Q7LGA3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HS2ST1Q7LGA3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms