Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q71RC1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q71RC1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Q71RC1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Q71RC1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q71RC1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q71RC1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q71RC1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q71RC1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q71RC1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q71RC1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q71RC1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q71RC1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q71RC1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q71RC1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q71RC1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q71RC1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q71RC1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q71RC1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q71RC1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q71RC1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q71RC1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q71RC1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q71RC1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q71RC1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q71RC1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q71RC1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q71RC1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q71RC1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q71RC1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q71RC1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q71RC1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q71RC1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q71RC1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q71RC1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q71RC1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q71RC1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q71RC1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q71RC1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Q71RC1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q71RC1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q71RC1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q71RC1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q71RC1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q71RC1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q71RC1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q71RC1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q71RC1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q71RC1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q71RC1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q71RC1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q71RC1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q71RC1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q71RC1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q71RC1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Q71RC1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q71RC1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q71RC1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q71RC1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q71RC1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q71RC1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q71RC1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q71RC1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q71RC1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q71RC1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Q71RC1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q71RC1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q71RC1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q71RC1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q71RC1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q71RC1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q71RC1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q71RC1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q71RC1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q71RC1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q71RC1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q71RC1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q71RC1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q71RC1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q71RC1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q71RC1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q71RC1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q71RC1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q71RC1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q71RC1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q71RC1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q71RC1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q71RC1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q71RC1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q71RC1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q71RC1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q71RC1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q71RC1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q71RC1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q71RC1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q71RC1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q71RC1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Q71RC1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Q71RC1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q71RC1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms