Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
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USP53Q70EK8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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USP53Q70EK8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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USP53Q70EK8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP53Q70EK8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP53Q70EK8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP53Q70EK8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP53Q70EK8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP53Q70EK8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP53Q70EK8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP53Q70EK8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP53Q70EK8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP53Q70EK8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP53Q70EK8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP53Q70EK8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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