Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX8Q6ZV50 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms