Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SRCAPQ6ZRS2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms