Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC36A4Q6YBV0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms