Protein–RNA interactions for Protein: Q6XD76

ASCL4, Achaete-scute homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL4Q6XD76 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL4Q6XD76 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ASCL4Q6XD76 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASCL4Q6XD76 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms