Protein–RNA interactions for Protein: Q6SZW1

SARM1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARM1Q6SZW1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SARM1Q6SZW1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SARM1Q6SZW1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SARM1Q6SZW1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms