Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKN3Q6P5Z2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKN3Q6P5Z2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms