Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD54Q6NXT1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms