Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFSP1Q6NVU6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFSP1Q6NVU6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFSP1Q6NVU6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFSP1Q6NVU6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP1Q6NVU6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP1Q6NVU6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP1Q6NVU6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP1Q6NVU6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP1Q6NVU6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP1Q6NVU6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP1Q6NVU6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP1Q6NVU6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP1Q6NVU6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP1Q6NVU6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP1Q6NVU6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP1Q6NVU6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP1Q6NVU6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP1Q6NVU6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP1Q6NVU6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP1Q6NVU6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP1Q6NVU6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP1Q6NVU6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP1Q6NVU6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP1Q6NVU6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms