Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATL3Q6DD88 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms