Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TNS3Q68CZ2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNS3Q68CZ2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms