Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
CARMIL1Q5VZK9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CARMIL1Q5VZK9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms