Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SHEQ5VZ18 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SHEQ5VZ18 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHEQ5VZ18 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHEQ5VZ18 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHEQ5VZ18 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHEQ5VZ18 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHEQ5VZ18 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHEQ5VZ18 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHEQ5VZ18 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHEQ5VZ18 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHEQ5VZ18 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHEQ5VZ18 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHEQ5VZ18 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHEQ5VZ18 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHEQ5VZ18 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHEQ5VZ18 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHEQ5VZ18 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHEQ5VZ18 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHEQ5VZ18 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SHEQ5VZ18 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SHEQ5VZ18 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SHEQ5VZ18 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SHEQ5VZ18 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SHEQ5VZ18 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SHEQ5VZ18 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms