Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
OTUD1Q5VV17 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUD1Q5VV17 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms