Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ9

EFCAB2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB2Q5VUJ9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
EFCAB2Q5VUJ9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
EFCAB2Q5VUJ9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
EFCAB2Q5VUJ9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
EFCAB2Q5VUJ9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
EFCAB2Q5VUJ9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
EFCAB2Q5VUJ9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
EFCAB2Q5VUJ9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
EFCAB2Q5VUJ9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
EFCAB2Q5VUJ9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
EFCAB2Q5VUJ9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
EFCAB2Q5VUJ9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
EFCAB2Q5VUJ9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
EFCAB2Q5VUJ9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
EFCAB2Q5VUJ9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
EFCAB2Q5VUJ9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
EFCAB2Q5VUJ9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
EFCAB2Q5VUJ9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
EFCAB2Q5VUJ9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
EFCAB2Q5VUJ9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
EFCAB2Q5VUJ9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
EFCAB2Q5VUJ9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
EFCAB2Q5VUJ9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
EFCAB2Q5VUJ9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
EFCAB2Q5VUJ9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
EFCAB2Q5VUJ9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
EFCAB2Q5VUJ9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
EFCAB2Q5VUJ9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
EFCAB2Q5VUJ9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
EFCAB2Q5VUJ9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
EFCAB2Q5VUJ9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
EFCAB2Q5VUJ9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
EFCAB2Q5VUJ9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
EFCAB2Q5VUJ9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
EFCAB2Q5VUJ9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC32.5■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC32.48■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
EFCAB2Q5VUJ9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms