Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
STRIP1Q5VSL9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRIP1Q5VSL9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms