Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM164Q5U3C3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms