Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
UBAP2Q5T6F2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBAP2Q5T6F2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms