Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRMS1LQ5PSV4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms