Protein–RNA interactions for Protein: Q5PRF9

SAMD4B, Protein Smaug homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4BQ5PRF9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD4BQ5PRF9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms