Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms