Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HABP4Q5JVS0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HABP4Q5JVS0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HABP4Q5JVS0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HABP4Q5JVS0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HABP4Q5JVS0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HABP4Q5JVS0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HABP4Q5JVS0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HABP4Q5JVS0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HABP4Q5JVS0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HABP4Q5JVS0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HABP4Q5JVS0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HABP4Q5JVS0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HABP4Q5JVS0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HABP4Q5JVS0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HABP4Q5JVS0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HABP4Q5JVS0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HABP4Q5JVS0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HABP4Q5JVS0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HABP4Q5JVS0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HABP4Q5JVS0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HABP4Q5JVS0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HABP4Q5JVS0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HABP4Q5JVS0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HABP4Q5JVS0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HABP4Q5JVS0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HABP4Q5JVS0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HABP4Q5JVS0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HABP4Q5JVS0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HABP4Q5JVS0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HABP4Q5JVS0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HABP4Q5JVS0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HABP4Q5JVS0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HABP4Q5JVS0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HABP4Q5JVS0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HABP4Q5JVS0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HABP4Q5JVS0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HABP4Q5JVS0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms