Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM47AQ5JRC9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM47AQ5JRC9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms