Protein–RNA interactions for Protein: Q5BLP8

C4orf48, Neuropeptide-like protein C4orf48, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48Q5BLP8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 ELL2P2-201ENST00000515135 694 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 AC068987.2-201ENST00000565518 896 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 MAPK10-379ENST00000642013 1385 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 FGA-203ENST00000622532 1130 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C4orf48Q5BLP8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms