Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC178Q5BJE1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms