Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SDK2Q58EX2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms