Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAN3Q58A45 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms