Protein–RNA interactions for Protein: Q53T94

TAF1B, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1BQ53T94 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1BQ53T94 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1BQ53T94 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms