Protein–RNA interactions for Protein: Q502W6

VWA3B, von Willebrand factor A domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3BQ502W6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA3BQ502W6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA3BQ502W6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms