Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJI4

SLC9B1, Sodium/hydrogen exchanger 9B1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9B1Q4ZJI4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC9B1Q4ZJI4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC9B1Q4ZJI4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC9B1Q4ZJI4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC9B1Q4ZJI4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC9B1Q4ZJI4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC9B1Q4ZJI4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC9B1Q4ZJI4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC9B1Q4ZJI4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC9B1Q4ZJI4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC9B1Q4ZJI4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC9B1Q4ZJI4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC9B1Q4ZJI4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC9B1Q4ZJI4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC9B1Q4ZJI4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC9B1Q4ZJI4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC9B1Q4ZJI4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC9B1Q4ZJI4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC9B1Q4ZJI4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC9B1Q4ZJI4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC9B1Q4ZJI4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC9B1Q4ZJI4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC9B1Q4ZJI4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC9B1Q4ZJI4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC9B1Q4ZJI4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC9B1Q4ZJI4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC9B1Q4ZJI4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC9B1Q4ZJI4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC9B1Q4ZJI4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC9B1Q4ZJI4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC9B1Q4ZJI4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC9B1Q4ZJI4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC9B1Q4ZJI4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC9B1Q4ZJI4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC9B1Q4ZJI4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC9B1Q4ZJI4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9B1Q4ZJI4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms