Protein–RNA interactions for Protein: Q4W5G0

TIGD2, Tigger transposable element-derived protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD2Q4W5G0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIGD2Q4W5G0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIGD2Q4W5G0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms